东北师范大学科研机构建有国家工程实验室、国家野外科学观测研究站、国家地方联合工程实验室、国家应用数学中心、国家国际联合研究中心、教育部重点实验室、教育部工程研究中心等国家级、部委级科技创新平台18个，教育部人文社会科学重点研究基地、教育部国别与区域研究中心等部委级人文社会科学研究平台10个
社会科学科研机构级别科研平台国家级科研机构教育部人文社会科学重点研究基地中国农村教育发展研究院教育部人文社会科学重点研究基地世界文明史研究中心教育部高校辅导员培训和研修基地（东北师大）教育部国别与区域研究中心东亚研究院国家民委“一带一路”国别和区域研究中心东亚研究院全国妇联妇女（性别）研究与培训基地女性研究中心教育部国际教育法治研究中心国家基础教育实验中心教师教育省部共建协同创新中心国家语言文字推广基地吉林省人文社科重点研究基地思想政治教育研究中心东亚研究院思想政治理论课教学方法改革研究中心中国基础外语教育研究中心中国地方政府治理现代化研究中心中国学校美育研究中心传统文化与当代中国哲学研究中心世界文学与比较文学研究中心城镇化与区域发展研究中心学校艺术教育质量监测研究基地吉剧艺术与文化研究基地中国共产党思想政治教育文献研究中心心理健康教育研究中心东北抗联与伪满洲国资料研究中心英语语言史研究中心西方马克思主义现代性理论研究中心吉林省重大需求协同创新中心教师教育东北协同创新中心中国农村教育发展重大需求协同创新中心创新创业教育重大需求协同创新中心教育信息化重大需求协同创新中心文化创意产业协同创新中心（培育）长白山音乐舞蹈艺术协同创新中心（培育）吉林省特色新型高校智库思想政治教育研究中心东亚文明研究中心中国地方政府治理现代化研究中心社会主义核心价值观教育研究中心（培育）中国体育公共外交研究中心（培育）其它省级智库党内法规建设研究基地吉林省法治理论研究基地吉林省社会科学重点研究领域基地“伪满”历史文化研究基地吉林省高等教育研究基地吉林省现代大学治理研究基地校、院共管科研机构世界古典文明史研究所古籍整理研究所世界中古史研究所日本研究所亚洲文明研究院思想理论教育研究所当代中国马克思主义研究中心国际与比较教育研究所儿童发展研究中心教师教育研究院中国东北研究院东北工作站艺术研究中心高校党建研究所高等教育研究所乡村振兴研究院 自然科学研究机构级别科研平台国家工程实验室药物基因和蛋白筛选国家工程实验室国家野外科学观测研究站吉林松嫩草地生态系统国家野外科学观测研究站生态环境部重点实验室国家环境保护湿地生态与植被恢复重点实验室国家地方联合工程实验室动力电池国家地方联合工程实验室国家草品种区域试验站国家草品种区域试验站（长岭）国家应用数学中心吉林国家应用数学中心国家药监局重点实验室细胞和基因药物质量控制重点实验室教育部重点实验室植被生态科学教育部重点实验室多酸与网格材料化学教育部重点实验室应用统计教育部重点实验室分子表观遗传学教育部重点实验室紫外光发射材料与技术教育部重点实验室长白山地理过程与生态安全教育部重点实验室教育部工程研究中心农业与医药基因工程研究中心数字化学习支撑技术工程研究中心糖复合物教育部工程研究中心东北地区水环境低碳绿色发展教育部工程研究中心教育部野外科学观测研究站松嫩草地生态系统教育部野外科学观测研究站吉林省重点实验室吉林省生态恢复与生态系统管理重点实验室吉林省有机功能分子设计与合成重点实验室吉林省动物资源保护与利用重点实验室吉林省长白山天然药物化学与生物学重点实验室吉林省先进能源开发及应用创新重点实验室吉林省神经可塑性重点实验室吉林省可持续先进功能材料重点实验室吉林省长白山湿地生态过程与环境变化重点实验室吉林省大数据分析重点实验室吉林省认知神经科学与脑智发展重点实验室吉林省冰雪运动重点实验室吉林省科技创新中心吉林省锂离子电池材料科技创新中心吉林省湿地恢复与功能开发科技创新中心吉林省多酸及金属纳米材料科技创新中心吉林省经济植物生物技术科技创新中心吉林省城市污水处理与水质保障科技创新中心吉林省人类干细胞库科技创新中心吉林省“互联网+”教育科技创新中心-智慧教育分中心吉林省“互联网+”教育科技创新中心-知识媒体技术分中心吉林省航天特种涂层材料科技创新中心吉林省农业气象灾害风险评估与防控科技创新中心吉林省教育人工智能跨区域合作科技创新中心吉林省应用数学中心吉林省应用数学与交叉科学中心吉林省国际合作基地人类干细胞库国际（科技合作基地）联合研究中心数据驱动的应用统计方法研究国际科技合作基地吉林省湿地生态科技国际合作基地草地生态与管理利用国际联合研究中心吉林省工程实验室吉林省脑认知与类脑智能工程实验室吉林省工程研究中心吉林省教育与人工智能融合创新工程研究中心吉林省高等学校重点实验室中国东北资源环境研究吉林省高等学校重点实验室教育软件吉林省高等学校重点实验室智能信息处理吉林省高等学校重点实验室认知与脑科学吉林省高等学校重点实验室纳米生物传感分析吉林省高等学校重点实验室吉林省高端科技创新平台“先进能源材料研究中心”东师生物分子制备与应用创新训练中心固态电池吉林省协同创新中心吉林省草产品工程联合技术创新实验室吉林省协同创新中心固态电池吉林省协同创新中心吉林省高端科技创新平台先进能源材料研究中心其他省级科研机构吉林省中药生物工程重点研究室吉林省现代生物医药专业技术服务中心长春市网络教育关键支撑技术科技创新中心生物医药产业药物筛选技术公共服务平台医药产业药品质量检测技术公共服务平台校内科研机构应用数学研究所、大应用数学实验室、生物数学中心、统计信息咨询中心、数学交叉科学中心、先进光电子功能材料研究中心、量子科学中心、理论物理研究所、辐射技术研究所、应用电子技术研究所、物理学科教育研究所、先进能源技术研究所、分析测试中心、多酸化学研究所、功能材料化学研究所、化学教育研究所、草地研究所、遗传与细胞研究所、分子表观遗传学实验室、电镜中心、泥炭沼泽研究所、土地资源管理研究所、遥感与地理信息系统中心、环境科学研究所、环境工程研究中心、综合灾害风险管理研究中心、龙湾湿地生态产业研究院、物联网应用技术研究所、计算生物研究所、自然资源研究中心、智能+课程与教材研究中心、东北地区双碳战略研究院
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