吉林体育学院科研机构截至2022年11月，学校有吉林省重大需求协同创新中心1个，国家体育总局耐力项目重点实验室1个，吉林省普通高校重点实验室5个；国家体育总局体育社会科学重点研究基地1个，吉林省高校人文社会科学重点研究基地2个，吉林省特色文化吉林冰雪文化研究基地1个，吉林省社会科学重点领域研究基地2个
国家级科研基地：国家体育总局体育社会科学重点研究基地、国家体育总局耐力项目重点实验室吉林省重大需求协同创新中心：吉林省运动健康关键技术重大需求协同创新中心吉林省社会科学重点领域研究基地：吉林省社会科学重点领域吉林省体育产业研究基地、吉林省社会科学重点领域吉林省风险评估研究基地吉林省高校人文社会科学重点研究基地：全民健身产业化理论与实践研究中心、体育教育训练科学研究基地 吉林省普通高校重点实验室：吉林体育学院运动人体科学吉林省高校重点实验室、科学化训练实验室、运动心理实验室
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