南京医科大学科研平台截至2023年5月，学校建有生殖医学与子代健康全国重点实验室、环境与人类健康国际联合研究中心、肿瘤个体化医学省部共建协同创新中心等30多个国家级、省部级重点实验室（工程研究中心、创新中心）

拥有国内一流的医学模拟教育中心和江苏省医药动物实验基地，建有省内唯一的省级卫生政策智库—江苏省健康研究院

 全国重点实验室：生殖医学与子代健康全国重点实验室、络病理论创新转化全国重点实验室（合作）省部共建协同创新中心：肿瘤个体化医学省部共建协同创新中心国家级国际联合研究中心：环境与人类健康国际联合研究中心教育部重点实验室：现代毒理学教育部重点实验室教育部工程研究中心：智能诊疗技术及器械教育部工程研究中心国家卫生健康委员会重点实验室：抗体技术重点实验室、生殖医学重点实验室、活体肝移植重点实验室（第一附属医院）江苏省协同创新中心：江苏省心血管病转化医学协同创新中心、江苏省肿瘤个体化医学协同创新中心 江苏省重点实验室：江苏省人类功能基因组学重点实验室、江苏省异种移植重点实验室、江苏省恶性肿瘤分子生物学及转化医学重点实验室（附属肿瘤医院）江苏省高校重点实验室：江苏省心血管病分子干预重点实验室（国家重点实验室培育点）、江苏省现代病原生物学重点实验室、江苏省神经退行性疾病重点实验室、江苏省恶性肿瘤生物标志物与防治重点实验室、江苏省口腔疾病研究重点实验室、江苏省儿童重大疾病研究重点实验室、江苏省老年医学重点实验室、江苏省应用毒理学重点实验室、江苏省生殖医学重点实验室江苏省科技公共服务平台：江苏省医药、农药、兽药安全性评价与研究中心、江苏省医药动物实验基地、江苏省临床研究与循证医学中心江苏省工程研究中心：江苏省区域卫生信息化工程中心、江苏省心血管病诊疗器械与设备工程实验室、江苏省智能穿戴监护与康复器械工程研究中心、江苏省口腔转化医学工程研究中心、江苏省抗体药物工程研究中心、江苏省环境健康风险评估工程研究中心、江苏省骨科机器人工程研究中心、江苏省抗衰弱体卫融合工程研究中心、江苏省眼科学和视觉科学工程研究中心、江苏省数字医学与3D打印临床工程研究中心（附属南京医院）、江苏省慢病大数据应用与智慧健康服务工程研究中心（第一附属医院）、江苏省医学物理工程研究中心（附属常州二院）、江苏省重大疾病药物靶标工程研究中心江苏省技术标准创新基地：江苏省心血管防治技术标准创新基地江苏省国际联合实验室：中英心血管病联合实验室、心血管病国际合作联合实验室、健康信息与康复工程国际合作联合实验室、重大疾病药物靶标国际合作联合实验室江苏省智库：江苏省健康研究院其他省级平台：江苏省儿童青少年近视防控研究中心、江苏省儿童青少年口腔健康教育研究中心 

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