南京中医药大学院系专业截至2023年2月，学校设有9个学院及第一、二、三临床医学院等教学机构，拥有15个附属医院和3个附属药企，开设本科专业37个

   南京中医药大学院系专业一览表学院专业名称学制南京中医药大学中医学院·中西医结合学院中西医临床医学（本博贯通培养）9中西医临床医学5中医学（农村订单定向医学生免费培养计划）5南京中医药大学药学院中药学（与中国科学院上海药物研究所本博贯通联合培养）4中药学类（中药学、中药制药、中药资源与开发）4药学类（药学、药物制剂）4生物制药（分子生物学-药物研制）（中外合作办学）3+1食品质量与安全（中外合作办学）3+1制药工程4生物制药4南京中医药大学医学院·整合医学院中医学（中医拔尖创新人才培养模式改革）9临床医学5应用心理学4南京中医药大学针灸推拿学院·养生康复学院针灸推拿学5中医养生学5中医康复学5康复治疗学4食品卫生与营养学4康复治疗学（中外合作办学）4南京中医药大学护理学院护理学4助产学4南京中医药大学卫生经济管理学院国际经济与贸易4公共管理类4信息管理与信息系统4药事管理4大数据管理与应用4公共事业管理（中外合作办学）3+1南京中医药大学人工智能与信息技术学院计算机类（计算机科学与技术、软件工程）4医学信息工程4南京中医药大学第一临床医学院中医学（中医拔尖创新人才培养模式改革5+3一体化）5中医学5中医学（妇产科学）5中医儿科学5中医学（全科医学）5眼视光学4南京中医药大学养老服务与管理学院康复治疗学（老年康复）4临床医学（老年医学）5护理学（老年护理）4养老服务管理4 

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