遗传工程国家重点实验室（复旦大学）交流合作实验室遵循“合作、开放、提高”的原则，强调与国内有关单位的科研协作，协助本校生化系，微生物系，物理系等28个课题组的科研实验，与国家人类基因组南方研究中心、第二军医科大学、苏州大学（医学院）等15个科研单位建立了合作关系
积极参与国际性学术活动，已主办过发育遗传学与生物工程国际学术研讨会，第九届国际环境诱变剂大会和2002现代人类学国际研讨会等5次国际学术会议；与法国Pasteur 研究所，美国Yale大学等著名研究机构建立了多项国际合作项目；并组建了3个实质性的国际联合实验室（人类起源中美联合实验室、复旦－交大－诺丁汉植物生物技术中心、复旦－曼切斯特大学生物信息中心）
先后接待国内外访问者近2500人
科技部，教育部，基金委及上海市领导也多次莅临指导和视察
根据国家“十五”发展规划及本学科现状，实验室贯彻知识创新，科教兴国的战略方针，将进一步加强遗传学和遗传工程基础研究，力求建成具有国际先进水平的科研基地，人才培养基地和高新技术产业化的基地
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