黑龙江科技大学科研机构截至2022年10月，学校有煤矿深部开采地压控制与瓦斯治理实验室等5个省（部）级重点实验室，9个省（部）级工程中心、资源城市可持续发展研究中心1个省级智库和1个“矿产资源开发利用”省级协同创新中心

 国家级中心实验室：瓦斯等烃气输运管网安全基础研究实验室 省部级重点实验室：煤矿深部开采地压控制与瓦斯治理实验室、瓦斯等烃气输运管网安全基础研究实验室、黑龙江省石墨烯应用研究重点实验室、黑龙江省光学三维测量与检测重点实验室、黑龙江省矿物分选及矿产资源综合利用重点实验室省部级工程技术研究中心：黑龙江省洁净煤技术研究中心、黑龙江省微（纳）米石墨工程技术研究中心、黑龙江省3D打印工程技术研究中心、煤矿瓦斯分离与利用工程研究中心、黑龙江省采掘机械关键结构及装备工程技术研究中心、黑龙江省高效加工与检测工程技术研究中心、黑龙江省石墨烯粉体应用工程技术研究中心、黑龙江省煤矿瓦斯灾害防治与利用工程技术研究中心、黑龙江省工控信息网络安全检测工程技术研究中心省普通高校重点实验室：采矿工程重点实验室、矿物加工工程重点实验室省高校人文社科重点研究基地：煤炭资源经济研究中心 

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