中国科学技术大学建校初期1958年9月20日，中国科学技术大学成立暨开学典礼在中国人民解放军政治学院大礼堂举行

次日，《人民日报》《光明日报》均以《中国教育史和科学史上的一项重大事件》为题报道了中国科大的诞生

1959年，中国科学情报大学并入中国科大，设立科技情报系，1960年该系撤销，学生分别并入物理、化学、生物等系科专业

1964年4月，中国科学院同意将原来的13个系合并成数学系、物理系、近代化学系、近代物理系、近代力学系、无线电电子学系6个系

教育部核定学校设定专业24个，1966年减为23个，学制5年

根据中国科学院的要求，系和专业调整后，专业课程基本不变，教研室继续保留，以便经常和研究所取得密切联系

1959年5月，被列入中共中央的《关于在高等学校中指定一批重点学校的决定》

 中国科大1963年开始招收研究生，1964年中国科学院京区研究所录取的200名研究生也由中国科大负责基础课教学

地球物理学家赵九章曾致函科学院领导，建议中国科大开办研究生院

科学院对由中国科大在中关村开办研究生院问题也曾提出方案，后因“文革”动乱而搁浅

1960年中国科大与科学院计算研究所联合研制成功“107计算机”，这是中国第一台自行设计研制的通用数字计算机，也是中国高校中第一台电子数字计算机

1960年2月，学校召开第一次科学研究工作报告会

1963年9月，为纪念建校五周年出版的《科学论文集》，选入师生论文共80篇

截至1966年，中国科大为国家培养了4710名毕业生，85%分配在科研部门和高等院校工作，绝大部分成为业务和领导骨干

在前三届毕业生中，后来当选为“两院”院士者就有29人，在全国高校同期毕业生中名列第一

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