亳州职业技术学院院系专业截至2022年12月，学校设有9个二级教学单位，36个高职专业
教学院系专业药学院中药学、药学、中药制药技术、药品质量与安全、药品经营与管理、药品生产技术 医学院护理、康复治疗技术、针灸推拿、中医学 教育与管理学院学前教育、高速铁路客运服务、酒店管理与数字化运营、旅游管理、大数据与财务管理、市场营销、现代物流管理、连锁经营管理（商业连锁方向）、行政管理、婴幼儿托育服务与管理 信息工程系计算机应用技术、电子商务、软件技术、大数据技术、动漫设计与制作 智能工程系医疗器械维护与管理、机电一体化技术、电气自动化技术、工业机器人技术、汽车智能技术 建筑工程系建筑工程技术、建筑装饰工程技术、建筑设备工程技术、建筑室内设计、建筑工程造价、建筑设计
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