黑龙江农业经济职业学院院系专业据2023年4月学校官网显示，学校设有教学系部7个，开办高职专业47个
教学系部高职专业经济管理系现代农业经济管理、关务与外贸服务、市场营销、现代物流管理、旅游管理、酒店管理与数字化运营、大数据与财务管理、金融服务与管理、工程造价、大数据与会计、商务数据分析与应用信息工程系软件技术、计算机应用技术、电子商务、跨境电子商务、动漫制作技术、建筑室内设计、网络技术、物联网应用技术、大数据技术与应用智慧农业系作物生产与经营管理、绿色食品生产技术、种子生产与经营、园艺技术、风景园林设计、水利工程、食用菌生产与加工动物科技系畜牧兽医、动物医学、宠物养护与驯导、宠物医疗技术食品药品工程系食品智能加工技术、食品检验检测技术、中药制药、生物制药技术、药品经营与管理、药品生产技术、健康管理机电工程系数控技术、机电一体化技术、工业机器人技术、汽车检测与维修技术、新能源汽车技术、现代农业装备应用技术人文艺术系新闻采编与制作、婴幼儿托育服务与管理、广告艺术设计思想政治理论课教学科研部——参考资料：
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