福建中医药大学学科建设截至2023年3月，学校有3个博士专业学位授权点，有7个硕士学位授权一级学科，有4个硕士专业学位类别；有2个博士后科研流动站

有20个国家中医药管理局重点学科，中西医结合、中医学2个福建省A类高峰学科，中药学、护理学、药学3个福建省高原学科，临床医学、管理学2个福建省应用型学科

临床医学学科进入ESI全球排名前1%行列

 博士专业学位授权点：中医学、中西医结合、中医博士 硕士学位授权一级学科：中医学、中西医结合、临床医学、药学、中药学、护理学、医学技术 硕士专业学位类别：中医学、中药学、药学、护理学 博士后科研流动站：中医学、中西医结合 国家中医药管理局重点学科：伤寒学、中医文献学、方剂学、中医诊断学、中医脾胃病学、中医骨伤科学、中医康复学、中医护理学、针灸学、中药化学、中西医结合临床、内经学、中医急诊学、中医养生学、推拿学、中药分析学、临床中药学、中西医结合基础、中医心理学、中医预防医学福建省重点学科：中西医结合、护理学、康复医学、临床医学、药学、中药学、中医学福建省特色重点学科：中西医结合、临床医学（康复医学方向） 

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