福建医科大学学术资源学术刊物学校出版的学术刊物《福建医科大学学报》、《福建医科大学学报（社科版）》、《中华高血压杂志》和《心血管康复医学杂志》等

《福建医科大学学报》创刊于1959年，是医药卫生综合类学术期刊，国内外公开发行，被《中国学术期刊（光盘版）》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《万方数据-数字化期刊群》、《中国医学文摘》、《中国生物学文摘》等重要数据库和文摘期刊收录 

《福建医科大学学报（社会科学版）》前身为创办于1983年的《高等医学教育研究》半年刊，内部发行

学报已被《中国期刊网》、《中国期刊全文数据库（CJFD）》、《中国学术期刊（光盘版）》、《中国学术期刊综合评价数据库》、《中文科技期刊数据库》、《万方数据——数字化期刊群》、《中国核心期刊（遴选）数据库》等数据库全文收录 

《中华高血压杂志》创刊于1993年，由中华预防医学会、福建医科大学主办，福建医科大学附属第一医院承办，为中华预防医学会系列杂志，高血压联盟（中国）学术期刊，是中文核心期刊、中国科技核心期刊、中国科技引文数据库收录期刊、中国科学评价中心核心学术期刊、中国核心期刊（遴选）数据库收录期刊、中国医学核心期刊、美国《化学文摘》收录期刊、WHO西太平洋地区医学索引数据库收录期刊 

馆藏资源截至2021年8月，福建医科大学图书馆藏有纸质图书总量171.93万册，电子图书440.27万册，电子期刊81万册，学位论文967.06万册，音视频44645小时，数据库79个（包含子库），其中包含CNKI、万方、维普等中文数据库39个，OVID外文医学检索平台、LWW医学全文期刊、EBMR、BP、FMRS、牛津、海量外文图书等外文数据库34个，自建库4个，附属医院数据库2个

数据存储容量总计近60T

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