哈尔滨医科大学合并组建1949年4月，哈尔滨医科大学与中国医科大学一、二分校合并，组建成新的哈尔滨医科大学

1954年，学校归卫生部领导

1956年6月，学校更名为哈尔滨医学院

1955年7月，根据国家教育部关于院系调整的决定，中国医科大学公共卫生学系并入哈尔滨医学院，哈尔滨医学院儿科学系并入中国医科大学

 1958年4月，卫生部将哈尔滨医学院移交黑龙江省领导

11月，学校恢复哈尔滨医科大学校名

1962年，中国医科大学公共卫生学系重新并入哈尔滨医科大学

1978年4月，黑龙江省肿瘤医院划归哈尔滨医科大学成为哈尔滨医科大学附属医院

1981年11月，经国务院批准，学校成为全国首批博士学位点医学院校

  2000年5月26日，经黑龙江省人民政府批准，鸡西煤炭医学高等专科学校（建立于1958年6月）并入哈尔滨医科大学，成为哈尔滨医科大学分校，但保留了鸡西医专的建制

 2001年，学校顺利通过省政府“211工程” “九五”期间建设项目检查验收，“211工程”“十五”期间建设项目得到批准，二期工程建设正式启动

 2002年5月13日，经国家教育部批准，撤销鸡西煤炭医学高等专科学校的建制，实质性并入哈尔滨医科大学

 2003年，学校通过教育部七年制高等医学教育教学评估，并获得优异成绩

  2004年，学校在黑龙江省大庆市建立哈尔滨医科大学大庆校区

接收哈尔滨铁路中心医院组建附属第四医院并挂牌成立；学校接收哈尔滨铁路肿瘤医院并入附属第三医院

   2005年，学校获教育部本科教学工作水平评估等优秀成绩

  2010年，入选国家”特色重点学科项目“建设高校

 2011年底，入选国家建设高水平大学公派研究生项目

2012年11月，学校入选第一批卓越医生教育培养计划项目试点高校，承担拔尖创新医学人才培养模式改革试点和五年制临床医学人才培养模式改革试点项目

 2013年5月22日，国家发改委、教育部正式公布“中西部高校基础能力建设工程”项目高校名单，哈尔滨医科大学入选

 同月，入选第一批临床医学硕士专业学位研究生培养模式改革试点高校

 2014年，学校作为牵头方成立中俄医科大学联盟

  2015年10月24日，哈尔滨医科大学正式被教育部、国家卫生和计划生育委员会、黑龙江省人民政府批准为共建大学

11月20日，哈尔滨医科大学获批“部委省”共建大学建设启动会举行

  2018年2月，学校入选黑龙江省高水平大学和优势特色学科建设高校及建设学科

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